KIKi keskkonnaprogrammist rahastatav keskkonnakorralduse programm annab toetust nii erinevatele uuringutele kui ka muudele töödele, mille abil energeetika negatiivset mõju keskkonnale vähendatakse ja nt õhu olukorda parandatakse – olgu see siis läbi maastike taastamise (nt vanad karjäärid) või taastuvenergeetika kasutamise. Taastuvenergeetikale, täpsemalt koostootmisjaamade ja säästlikema katlamajade ehitamiseks ning soojustrasside renoveerimiseks sai 2009. aastal toetust küsida ka Euroopa Regionaalarengufondist (ERF) ning toona korraldatud taotlusvoor jäi ka viimaseks.
2010. aastal lisandus rahaallikana roheline investeerimisskeem ehk CO2 kvoodimüügist saadav tulu, mille toetussuunad sõltuvad juba ostja soovidest. Praegu läbi KIKi suunatavad toetused on mõeldud koostootmisjaamade, katlamajade ja soojustrasside renoveerimiseks ning tuulenergia arendamiseks. Täiendavalt on käivitunud ka tänavavalgustuse rekonstrueerimise programm.
Keskkonnakorralduse programmist saab toetust taotleda igal aastal (üldjuhul kaks korda aastas), rohelise investeerimisskeemi toetuste taotlusvoorud ning toetuste sisu sõltub kvoodimüügi edukusest ja ostja soovidest.
